ABORDAGENS PROTEÔMICAS IN SILICO PARA ANÁLISE DE BIOMARCADORES DE FUNÇÃO E LESÃO DE DOENÇAS CARDIOVASCULARES.

Camila Carpanez Soares; Lorena Alcantara Loiola; Ana Clara Martinez Araújo; Caroline Fernandes-Santos; Giovani Carlo Veríssimo da Costa

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Trabalho

DOI

10.29327/fisiopat2023.656679

Título do Trabalho

ABORDAGENS PROTEÔMICAS IN SILICO PARA ANÁLISE DE BIOMARCADORES DE FUNÇÃO E LESÃO DE DOENÇAS CARDIOVASCULARES.

Autores

Camila Carpanez Soares
Lorena Alcantara Loiola
Ana Clara Martinez Araújo
Caroline Fernandes-Santos
Giovani Carlo Veríssimo da Costa

Modalidade

Resumo

Área temática

Doenças Cardiovasculares

Data de Publicação

10/02/2025

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

Português

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/fisiopat2023/656679-abordagens-proteomicas-in-silico-para-analise-de-biomarcadores-de-funcao-e-lesao-de-doencas-cardiovasculares

ISBN

978-65-272-1162-4

Palavras-Chave

proteômica, abordagem in sílico, doenças cardiovasculares.

Resumo

Introdução: As doenças cardiovasculares são as maiores causas de morbimortalidade no Brasil e no mundo. Desta forma, a análise laboratorial torna-se uma importante aliada na detecção e quantificação de biomarcadores da função e lesão cardiovascular, tais como troponina e mioglobina. Atualmente, utiliza-se em laboratórios clínicos testes unitários convencionais baseados em espectrofotometria e/ou testes de fluxo lateral para detecção e quantificação de biomarcadores, o que eleva o custo. Contudo, a medicina diagnóstica moderna tem evoluído para o uso de metodologias multianalíticas, possibilitando a detecção de marcadores diversos em um único ensaio. Dessa forma, se faz importante o desenvolvimento de novas tecnologias, o que torna a proteômica in silico uma importante aliada na aquisição de espectros de massas específicos de moléculas-alvos para aplicação de abordagens in vitro, servindo como estudos preliminares para o estabelecimento de protocolos experimentais. Objetivo: Realizar abordagens de digestão de proteínas in silico através de digestão proteolítica específica para biomarcadores de lesão e função cardíaca, a partir de programas computacionais. Métodos: Foram utilizadas para a pesquisa a troponina I e a mioglobina e como enzima proteolítica a Lys-C. Atrelado a isso, alguns sites e software foram utilizados para retirar e processar as informações, sendo aplicado na seguinte ordem de uso:1. UniProt: obtenção das sequências intactas das proteínas. 2. Mmass: inserção da sequência da proteína intacta e seleção da enzima desejada, com análise individual de cada proteína- inserção da sequência, clivagem e geração de várias sequências de fragmentos. 3. Blast: Comparação individual das sequências clivadas pela Lys-C com o banco de dados UniProt-SwissProt através da explosão Blast, identificando as sequências de peptídeos proteotípicos. 4. Mmass: avaliação da massa e carga de cada clivagem, sendo selecionado “Miscl=0 (para que não haja perda de clivagens) e “max charge”=7 (=2 a =7). Apenas as clivagens peptídicas com número superior a 10 resíduos de aminoácidos foram utilizados na busca. Resultados: Até o momento, foram encontrados na troponina I pela Lys-C vinte (22) íons precursores preditos com carga (z) entre +2 e +7, enquanto que para mioglobina foram encontrados apenas 10. Além disso, todas os fragmentos originados pela clivagem resultaram em massa menor que 2000 Daltons. A partir dessa análise, será inserido no Blast essas sequências de fragmentos, para que possa ser avaliado as sequências proteotípicas de peptídeos. Esses resultados se tornam importantes, visto que a troponina I é uma molécula de alta especificidade para o tecido cardíaco e, em níveis elevados, pode indicar uma lesão miocárdica. Assim como a troponina, a mioglobina também é importante mesmo não sendo um biomarcador cardioespecífico, porque se eleva rapidamente em casos de infarto e reinfarto do miocárdio. Conclusão: Os resultados encontrados demostraram que a análise in silico possibilitou a predição de possíveis alvos específicos utilizados em análises através de espectrometria de massas para biomarcadores de função e lesão cardiovascular. Novas análises utilizando diferentes enzimas proteolíticas e também novas proteínas alvo estão sendo realizadas para a ampliação de estudos experimentais.

Título do Evento: II Congresso de Fisiologia e Patologia
Cidade do Evento: Rio de Janeiro
Título dos Anais do Evento: Anais do Congresso de Fisiologia e Patologia
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital
DOI

Como citar

SOARES, Camila Carpanez et al.. ABORDAGENS PROTEÔMICAS IN SILICO PARA ANÁLISE DE BIOMARCADORES DE FUNÇÃO E LESÃO DE DOENÇAS CARDIOVASCULARES... In: Anais do Congresso de Fisiologia e Patologia. Anais...Rio de Janeiro(RJ) Fiocruz, 2023. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/fisiopat2023/656679-ABORDAGENS-PROTEOMICAS-IN-SILICO-PARA-ANALISE-DE-BIOMARCADORES-DE-FUNCAO-E-LESAO-DE-DOENCAS-CARDIOVASCULARES. Acesso em: 30/04/2025