O curso tem como objetivo fornecer conhecimento e treinamento nas metodologias de obtenção, edição e análise de sequencias de DNA voltadas para a análise filogenética e identificação de espécies, com ênfase em microrganismos. Os participantes receberão treinamento para trabalhar com sequencias de DNA desde a geração pelo sequenciador automático até a obtenção, edição e interpretação de árvores filogenéticas.
Ementa (Português/Inglês) A disciplina terá carga horária de 60 horas, sendo 30 horas teóricas e
30 horas de conteúdo prático. Os discentes terão oportunidade de trabalhar
com seu próprio material (sequencias de DNA) durante as aulas práticas, não
sendo essa uma condição obrigatória. Para tanto, o conteúdo que será abordado
irá contemplar os temas: Conteúdo Teórico: Conceitos básicos em taxonomia, sistemática e filogenia molecular; Critérios
para identificação de espécies em diferentes organismos: seleção de genes
apropriados e problemas frequentemente encontrados; Identificação de espécies
em microrganismos: problemas e soluções; Obtenção, alinhamento e análise de
seqüências; Bancos de dados; Métodos de reconstrução filogenética e modelos
evolutivos; Princípios para escolha de sequências para compor a árvore
filogenética; Construção e interpretação de árvores filogenéticas. Conteúdo Prático: Identificação do problema a ser resolvido por cada aluno (objetivos do seu
projeto) e estratégias para alcançar os objetivos (Preferencialmente, cada
aluno irá trabalhar com o material de seu projeto); Obtenção de sequencias
consenso e análise de cromatogramas; Busca de sequencias em bancos de dados,
alinhamento e edição de alinhamentos; Construção de árvores filogenéticas
utilizando diferentes softwares; Alinhamento multigênico; Construção de
árvores multigênicas; Interpretação das árvores geradas por cada discente;
Redação do manuscrito individual. |